文章标题：Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma

发表时间：2024年05期

期刊名称：Cell

影响因子：455

研究概述

本研究利用单细胞测序和空间组学技术，深入探讨胶质瘤（GBM）的细胞类型组成与空间分布特征。研究团队通过使用XPJ的10x单细胞测序技术，分析了28例胶质瘤样本的细胞组成，揭示了胶质瘤细胞的多样性。根据已有的定义，研究者确认了IDH野生型GBM中的主要细胞状态，包括神经祖细胞样（neural progenitor-like，NPC）、少突胶质细胞祖细胞样（oligodendrocyte progenitor-like，OPC）、星形胶质细胞样（astrocyte-like，AC）、以及间充质细胞样（mesenchymal-like，MES），这些状态共同代表了胶质瘤中主要的恶性细胞和核心免疫细胞。

空间多组学技术揭示GBM中的细胞空间分布特征

研究团队借助XPJ的10xVisium空间转录组技术，对19个胶质瘤样本进行了空间分析。同时，使用AkoyaCODEX技术对12个GBM样本进行空间蛋白质组学分析。整合空间转录组与空间蛋白数据后，研究人员发现胶质瘤由多个小局部环境组成，每个环境中通常富含一种主要的细胞状态。

研究表明，胶质瘤的细胞分布呈现两种主要形式：有序和无序结构化的分布。无序结构化分布的区域通常与缺氧状态无关，比如早期IDH突变胶质瘤细胞的空间分布较为混乱。而有序结构化的分布区域则与增强的缺氧状态相关，特定的“状态配对”在多个尺度上优先接近，形成了一个五层的空间结构。此空间结构包括缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层及正常脑细胞层，显示出强烈的与缺氧相关性。

结论

综上所述，本研究为胶质瘤的细胞空间分布提供了新的视角，并强调了缺氧在这一空间分布中的核心作用。通过XPJ的先进技术，研究者们为理解胶质瘤的微环境及其抵抗机制打下了基础，为未来的治疗策略提供了新的思路。